Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r176G3UW31 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms