Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
BicraF8VPZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BicraF8VPZ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BicraF8VPZ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
BicraF8VPZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms