Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ercc6F8VPZ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ercc6F8VPZ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ercc6F8VPZ5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ercc6F8VPZ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms