Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Arid4aF8VPQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid4aF8VPQ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid4aF8VPQ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms