Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm28038F7BCN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm28038F7BCN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm28038F7BCN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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