Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm8005F6YKY3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8005F6YKY3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms