Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm340F6RGI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm340F6RGI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms