Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29094F6Q785 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29094F6Q785 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms