Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms