Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc7bE9Q9Y3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms