Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Col22a1E9Q7P1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col22a1E9Q7P1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col22a1E9Q7P1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms