Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DspE9Q557 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DspE9Q557 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DspE9Q557 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DspE9Q557 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DspE9Q557 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DspE9Q557 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms