Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20518E9Q548 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20518E9Q548 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms