Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930579F01RikE9Q3L6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms