Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt90E9Q1Z0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Krt90E9Q1Z0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt90E9Q1Z0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt90E9Q1Z0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms