Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3250E9Q1M3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3250E9Q1M3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3250E9Q1M3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms