Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdzd2E9Q1M1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd2E9Q1M1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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