Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3893E9Q1I1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3893E9Q1I1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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