Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0K5

Vmn2r63, Vomeronasal 2, receptor 63, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r63E9Q0K5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r63E9Q0K5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r63E9Q0K5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms