Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3095E9Q058 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3095E9Q058 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms