Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chd2E9PZM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chd2E9PZM4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chd2E9PZM4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms