Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm5415E9PXF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5415E9PXF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5415E9PXF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms