Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp54bE9PXC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54bE9PXC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms