Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4931408C20RikE9PWP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931408C20RikE9PWP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms