Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3002E9PW72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3002E9PW72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3002E9PW72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3002E9PW72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms