Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp839E9PUU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp839E9PUU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp839E9PUU5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms