Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3bE9PUL3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3bE9PUL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms