Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim12cD3Z3L3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim12cD3Z3L3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms