Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3676D3Z236 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3676D3Z236 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3676D3Z236 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3676D3Z236 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3676D3Z236 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3676D3Z236 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms