Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldlrad1D3YYZ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldlrad1D3YYZ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldlrad1D3YYZ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms