Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc170D3YXL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc170D3YXL0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms