Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1bB9EJ57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mterf1bB9EJ57 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mterf1bB9EJ57 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms