Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clip3B9EHT4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms