Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf11cB4XVP9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11cB4XVP9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11cB4XVP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms