Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pnldc1B2RXZ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms