Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc11B2RXC1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc11B2RXC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc11B2RXC1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms