Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
Abcc8B2RUS7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Abcc8B2RUS7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Abcc8B2RUS7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Abcc8B2RUS7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Abcc8B2RUS7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms