Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Zscan5bB2RTN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zscan5bB2RTN3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zscan5bB2RTN3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms