Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc22a28B2RT89 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a28B2RT89 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a28B2RT89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms