Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf518bB2RRE4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf518bB2RRE4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf518bB2RRE4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms