Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1bp1B2KF50 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms