Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brpf3B2KF05 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms