Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H60cB1B213 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H60cB1B213 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms