Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfx1B1AY10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nfx1B1AY10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms