Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NhsB1AV60 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NhsB1AV60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NhsB1AV60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms