Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spocd1B1ASB6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spocd1B1ASB6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spocd1B1ASB6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms