Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp36B1AQJ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms