Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-M5A7VMS3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M5A7VMS3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M5A7VMS3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms