Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Odf2A3KGV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Odf2A3KGV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf2A3KGV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms