Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtcflA2APF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms