Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prdm12A2AJ77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms